【NGS 次世代基因體資料科學】基礎教學 06 染色體長度資訊.chrom.sizes的使用
染色體長度資訊是很常見於分析程式當中會需要傳入的資料，這裡簡單說明如何取得
沒有特殊需求的話，可以直接使用IGV提供的現成數據
https://github.com/igvteam/igv/tree/master/genomes/sizes
像是常見的mm10
https://github.com/igvteam/igv/blob/master/genomes/sizes/mm10.chrom.sizes
就可以直接下載
curl https://raw.githubusercontent.com/igvteam/igv/master/genomes/sizes/mm10.chrom.sizes -o mm10.chrom.sizes
head mm10.chrom.sizes會得到
chr1 195471971
chr2 182113224
chr3 160039680
chr4 156508116
chr5 151834684
chr6 149736546
chr7 145441459
chr8 129401213
chr9 124595110
chr10 130694993或是去UCSC的網站下載
https://hgdownload.soe.ucsc.edu/downloads.html
如果是沒有提供的，在手上有參考基因組的原始檔FASTA(.fa)格式的情況下，可以用samtools計算：
samtools faidx mm10.fa cut f1,2 mm10.fa.fai > mm10.chrom.sizes
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